Sandøy kyrkje ble bygd i 1812. Det var grunneierne i Sandøy sokn som bygde kirka og drev den fram til 1899 da Sandøy kommune kjøpte kirka og kirkegården. 

Kirka er den første 8-kanta kirka som ble bygd i Romsdal. Byggverket er i tømmer og har 250 plasser. 

i 1912 ble blant annet rosemalingen på galleri og dører malt av Jenny Husøy, gift Wisth og kunstneren Lars Kinsarvik laget plan for rosemalingen. 

Altertavlen ble laget av “Tavle-Jacob” i 1818: “Udhugget og malet af Jacob Sørensen Giskegaard…”. Prekestolen og døpefonten er fra Sandøe Capel 1709-1812. Orgelet fra 1962 ble laget av Vestre orgel-fabrikk. 

Fram til 1812 var gravstedet på Aukra, Akerø prestegjeld, og fra 1812-1905 var gravstedet Sandøy kyrkjegard. Da fikk Harøya hjelpe-kirkegård. Harøy kyrkje ble bygd i 1934. 

Ved den minneverdige 200-års markeringen 1. pinsedag 2012 deltok 10 prester, biskop Ingeborg Midttømme og Harøy felleskor sammen med fullsatt kirke. Harøy Musikklag framførte 1812 overtyre.